Bon, sinon pour revenir à ton problème, je pense que ça n'en est pas un : à part un reglage du manche à l'aide du truss rod pour creuser un peu, ya pas de risque majeur : la tension sera inférieure à la version 12 cordes. Pourquoi ton manche risquerait il de vriller ? Ce qui importe, c'est d'avoir une tension homogène entre les 6 cordes : ce sera ton cas.
Pour finir, j'ai une acoustique 12 cordes que je n'utilise plus qu'en 6c et à part un 1/4 de tour de clé, ya rien eu de notable a signaler.
Maintenant, faut il vraiment que tu t'imposes de trouver un 12c pour passer en 6c: tu trouveras peut etre un confort avec la largeur du manche mais en contrepartie, tu restrainds vachement le choix possible : les 12c electriques, c'est rare. Tu fera forcement des conscessions importantes, juste pour avoir 50mm au sillet.
Autant te réhabituer à jouer sur de 46 mm : tu auras tout le choix que tu veux...