Si ton footswitch c'est ça :
Alors c'est pas bien compliqué normalement.
Déjà faut trouver si le "switchage" des canaux se fait sur la pointe ou l'anneau des jacks stereo.
Admettons que ça soit sur la pointe.
Tu prends un DPDT, un switch à deux pôles, ce qui fait deux contacts en même temps en fait... et tu relies les cables qui vont aux pointes des jacks chacune sur un pole. Et de l'autre côté la masse.
Ensuite tu peux par exemple relier les anneaux de chaque jack (reverb/effects) sur son switch, et donc au final ça te donnera un footswitch avec trois switchs séparés (changement de canal sur les deux amplis/effets ampli1/effets amplis2), et deux cables qui vont chacun vers un ampli.
Ou alors si tu te sers pas des effets tu fais juste le switch pour changer de canal sur les deux amplis en même temps...
Après yaurait peut être d'autres méthodes qui puissent marcher mais faudrait tester.