C'est que tu as un problème d'impédance (guitare=haute impédance / entrée pc=basse impédance).
Ca se produit quand on branche une guitare passive directement sur une entrée pc micro ou ligne. Le fait d'intercaler une pédale corrige ce problème, mais il faut une pédale qui ait une sortie basse impédance, ce qui n'est pas toujours le cas.
Sinon, il te reste deux solutions : acheter une pédale d'effet avec le risque que ça ne corrige rien, ou investir dans une boite de direct (~50€) qui corrigera le problème.
Exemple de bonne boite de direct spécifiquement adaptée à la guitare (simulateur de HP),
la Behringer GI-100 :
Modérateur en grève. Vous pouvez déconner plein pot, je ne bougerai pas le petit doigt.