En ce qui me concerne, même si je ne joue pas la morceau dont tu parles, j'étouffe toujours avec la main qui gratouille dans le cas de figure que tu indiques, afin d'éviter les vibrations parasites. Parce que étouffer avec l'autre main tout en frettant la bonne case correspondant à la note que tu dois jouer, ça me parait "sportif"...
Comme dit précédemment, pour trouver la bonne manière d'étouffer, joue le passage aussi lentement que nécessaire pour qu'il soit propre, et accélère ensuite.